MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 1392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	ATCA	2	8	1566	1573	50 %	25 %	0 %	25 %	407484677
2	NC_018659	T	6	6	1582	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	407484677
3	NC_018659	ATGA	2	8	1589	1596	50 %	25 %	25 %	0 %	407484677
4	NC_018659	T	6	6	1629	1634	0 %	100 %	0 %	0 %	407484677
5	NC_018659	G	6	6	1658	1663	0 %	0 %	100 %	0 %	407484677
6	NC_018659	CGA	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484677
7	NC_018659	AG	3	6	1747	1752	50 %	0 %	50 %	0 %	407484677
8	NC_018659	ACG	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484677
9	NC_018659	TGGA	2	8	1833	1840	25 %	25 %	50 %	0 %	407484677
10	NC_018659	TGC	2	6	1873	1878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484677
11	NC_018659	CAGA	2	8	2031	2038	50 %	0 %	25 %	25 %	407484677
12	NC_018659	CAC	2	6	2115	2120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484677
13	NC_018659	TTAAC	2	10	2127	2136	40 %	40 %	0 %	20 %	407484677
14	NC_018659	TTA	2	6	2153	2158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484677
15	NC_018659	GT	3	6	2169	2174	0 %	50 %	50 %	0 %	407484677
16	NC_018659	GCA	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484677
17	NC_018659	GTT	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484677
18	NC_018659	TTCCGG	2	12	2278	2289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484677
19	NC_018659	CCT	2	6	2298	2303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484677
20	NC_018659	ATG	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484678
21	NC_018659	TCG	2	6	2501	2506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484678
22	NC_018659	TCA	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484679
23	NC_018659	GATA	2	8	2690	2697	50 %	25 %	25 %	0 %	407484679
24	NC_018659	CCAG	2	8	2706	2713	25 %	0 %	25 %	50 %	407484679
25	NC_018659	C	6	6	2720	2725	0 %	0 %	0 %	100 %	407484679
26	NC_018659	T	6	6	2738	2743	0 %	100 %	0 %	0 %	407484679
27	NC_018659	TGAT	2	8	2797	2804	25 %	50 %	25 %	0 %	407484679
28	NC_018659	GCA	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484679
29	NC_018659	CAT	2	6	2891	2896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484679
30	NC_018659	AGC	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484679
31	NC_018659	GCG	2	6	2967	2972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484679
32	NC_018659	GCC	2	6	2982	2987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484679
33	NC_018659	AGA	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484680
34	NC_018659	CAG	2	6	3082	3087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484680
35	NC_018659	CGAT	2	8	3101	3108	25 %	25 %	25 %	25 %	407484680
36	NC_018659	CAG	2	6	3115	3120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484680
37	NC_018659	TGC	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484680
38	NC_018659	CAG	3	9	3279	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484680
39	NC_018659	ACCGG	2	10	3440	3449	20 %	0 %	40 %	40 %	407484680
40	NC_018659	CTG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484680
41	NC_018659	TCA	2	6	3582	3587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484680
42	NC_018659	TGA	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484681
43	NC_018659	CAC	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484681
44	NC_018659	TAC	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484681
45	NC_018659	GAC	2	6	3754	3759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484681
46	NC_018659	T	7	7	3761	3767	0 %	100 %	0 %	0 %	407484681
47	NC_018659	ATT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484681
48	NC_018659	GGC	2	6	3830	3835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484681
49	NC_018659	ATC	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484681
50	NC_018659	TTC	2	6	3876	3881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484681
51	NC_018659	T	6	6	3886	3891	0 %	100 %	0 %	0 %	407484681
52	NC_018659	T	6	6	3947	3952	0 %	100 %	0 %	0 %	407484681
53	NC_018659	TCT	2	6	4003	4008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484681
54	NC_018659	TGA	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484681
55	NC_018659	TG	3	6	4060	4065	0 %	50 %	50 %	0 %	407484681
56	NC_018659	CAT	2	6	4094	4099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484681
57	NC_018659	GTT	2	6	4303	4308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
58	NC_018659	CAT	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484682
59	NC_018659	GTT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
60	NC_018659	CGT	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
61	NC_018659	CAA	2	6	4462	4467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484682
62	NC_018659	ACC	2	6	4565	4570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484682
63	NC_018659	CAC	2	6	4594	4599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484682
64	NC_018659	CCT	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484682
65	NC_018659	CCA	2	6	4852	4857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484682
66	NC_018659	AT	3	6	4959	4964	50 %	50 %	0 %	0 %	407484682
67	NC_018659	TGC	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
68	NC_018659	TGT	2	6	5069	5074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
69	NC_018659	TGGT	2	8	5110	5117	0 %	50 %	50 %	0 %	407484682
70	NC_018659	TAC	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484682
71	NC_018659	GCT	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
72	NC_018659	TCC	2	6	5199	5204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484682
73	NC_018659	TGC	2	6	5249	5254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
74	NC_018659	TGT	2	6	5259	5264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
75	NC_018659	ATT	2	6	5324	5329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484682
76	NC_018659	CCG	2	6	5412	5417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484682
77	NC_018659	TGC	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
78	NC_018659	GCC	3	9	5492	5500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484682
79	NC_018659	GAT	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484682
80	NC_018659	TTTC	2	8	5540	5547	0 %	75 %	0 %	25 %	407484682
81	NC_018659	AGT	2	6	5633	5638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484683
82	NC_018659	GAAC	2	8	5720	5727	50 %	0 %	25 %	25 %	407484683
83	NC_018659	GGA	2	6	5810	5815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484683
84	NC_018659	CAT	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484683
85	NC_018659	TGGT	2	8	5889	5896	0 %	50 %	50 %	0 %	407484683
86	NC_018659	GAC	2	6	5922	5927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484683
87	NC_018659	AGG	2	6	6109	6114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484683
88	NC_018659	CAC	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484683
89	NC_018659	GTT	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484683
90	NC_018659	AG	3	6	6227	6232	50 %	0 %	50 %	0 %	407484683
91	NC_018659	ACA	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484683
92	NC_018659	CGG	2	6	6318	6323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484683
93	NC_018659	GCAG	2	8	6380	6387	25 %	0 %	50 %	25 %	407484683
94	NC_018659	TCG	2	6	6462	6467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484683
95	NC_018659	GTGC	2	8	6476	6483	0 %	25 %	50 %	25 %	407484683
96	NC_018659	GGC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484683
97	NC_018659	ATC	2	6	6603	6608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484684
98	NC_018659	TCT	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484684
99	NC_018659	GAG	2	6	6906	6911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484684
100	NC_018659	CAT	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484684
101	NC_018659	GCTG	2	8	6999	7006	0 %	25 %	50 %	25 %	407484684
102	NC_018659	TTG	2	6	7009	7014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484684
103	NC_018659	GAC	2	6	7030	7035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484684
104	NC_018659	AAG	2	6	7112	7117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484684
105	NC_018659	ATT	2	6	7160	7165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484684
106	NC_018659	TTCA	2	8	7309	7316	25 %	50 %	0 %	25 %	407484685
107	NC_018659	GTC	2	6	7366	7371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484685
108	NC_018659	T	7	7	7404	7410	0 %	100 %	0 %	0 %	407484685
109	NC_018659	GACA	2	8	7418	7425	50 %	0 %	25 %	25 %	407484685
110	NC_018659	CGCT	2	8	7486	7493	0 %	25 %	25 %	50 %	407484685
111	NC_018659	TAC	2	6	7506	7511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484685
112	NC_018659	GCA	2	6	7544	7549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484685
113	NC_018659	GA	3	6	7648	7653	50 %	0 %	50 %	0 %	407484686
114	NC_018659	T	6	6	7667	7672	0 %	100 %	0 %	0 %	407484686
115	NC_018659	CCTG	2	8	7673	7680	0 %	25 %	25 %	50 %	407484686
116	NC_018659	TCC	2	6	7681	7686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484686
117	NC_018659	CTG	2	6	7707	7712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484686
118	NC_018659	GTT	2	6	7754	7759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484686
119	NC_018659	CAG	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484686
120	NC_018659	TTC	2	6	7791	7796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484686
121	NC_018659	TGT	2	6	7928	7933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484686
122	NC_018659	GGA	2	6	8366	8371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484686
123	NC_018659	AGTGTC	2	12	8392	8403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407484686
124	NC_018659	GTT	2	6	8444	8449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484686
125	NC_018659	C	6	6	8450	8455	0 %	0 %	0 %	100 %	407484686
126	NC_018659	TGC	2	6	8465	8470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484686
127	NC_018659	CAA	2	6	8489	8494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484686
128	NC_018659	CT	3	6	8560	8565	0 %	50 %	0 %	50 %	407484686
129	NC_018659	TGG	2	6	8583	8588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484686
130	NC_018659	TTC	2	6	8589	8594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484686
131	NC_018659	TGC	2	6	8601	8606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484686
132	NC_018659	TGA	2	6	8634	8639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484686
133	NC_018659	TGA	2	6	8661	8666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484686
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262	NC_018659	CAA	2	6	16176	16181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484692
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267	NC_018659	CAT	2	6	16728	16733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484692
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362	NC_018659	CGGG	2	8	23399	23406	0 %	0 %	75 %	25 %	407484699
363	NC_018659	ATAA	2	8	23407	23414	75 %	25 %	0 %	0 %	407484699
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380	NC_018659	TTTA	2	8	24105	24112	25 %	75 %	0 %	0 %	407484701
381	NC_018659	TGT	2	6	24127	24132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484701
382	NC_018659	TGACA	2	10	24179	24188	40 %	20 %	20 %	20 %	407484701
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385	NC_018659	TAA	2	6	24305	24310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484701
386	NC_018659	GCT	2	6	24324	24329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484701
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389	NC_018659	GAA	2	6	24448	24453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484701
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500	NC_018659	TGTT	2	8	29930	29937	0 %	75 %	25 %	0 %	407484705

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